El Proyecto Mesoamérica está integrado por tres ejes de trabajo: Eje Socioambiental, Eje Económico y Eje Institucional.
El Eje Socioambiental atiende retos fundamentales en salud pública, medio ambiente, gestión del riesgo, vivienda y seguridad alimentaria.
El Eje Económico considera temas cruciales para el desarrollo de infraestructura estratégica, seguridad energética, eficiencia del flujo de bienes y personas, y desarrollo digital.
